真菌性鼻窦炎是有可能会引发脑膜炎的并发症出现。这种并发症多出现在真菌性鼻窦炎的程度较为严重，真菌感染的面积较大，或者病情急性暴发性发作，没有得到及时控制的状况下发生。
因为鼻窦腔内的真菌性炎症感染如果不能得到有效地控制，或者患者使用了错误的擤鼻涕的方式，造成了含有真菌的鼻腔分泌物上行进入到了颅脑部位。或在真菌性鼻窦炎的治疗过程中，患者错误地使用了抗生素等的药物，导致真菌大量繁殖，都有可能会引发颅内、颅外的感染性疾病，也就是脑膜炎等类型的疾病发作。