卵巢囊肿剥除术后的后遗症主要包括有术后延迟的出血、盆腔的感染、盆腔的粘连以及卵巢囊肿的再次复发等。目前在临床上常用的卵巢囊肿剥离术通常是用腹腔镜辅助的，比较少用开腹手术。
腹腔镜是一种微创手术，创伤比较小，患者术中出血也少，对患者的损伤更小，恢复更快一点。另外在进行手术之前，医生会对患者进行详细的体格检查，充分评估患者的病情，排除患者的手术禁忌症，预测手术风险之后才会进行手术，这样就可以大大地降低手术中以及手术后的并发症、后遗症。
多数女性在卵巢囊肿术后都可以良好的恢复，很少有后遗症的出现。但是一定要定期的复查，以排除卵巢囊肿再次复发的可能，这个就不是卵巢囊肿手术后导致的后遗症。