肛瘘一般需要一个月左右的时间能够痊愈，愈合时间与肛瘘的分型有关。低位单纯性肛瘘治愈时间短，高位复杂性肛瘘治疗时间较长。甚至引起肛门失禁，排便困难的后遗症，后续的治疗时间更长，甚至需要再次手术。
肛瘘的临床特点是肛周瘘口持续性或者间歇性、排出脓性、血性渗液，其典型特点是肿块红肿疼痛、破溃流液 、症状消失，过段时间再次出现上述症状。肛瘘多有内口，有时候无外口，或者内外口均有，但是中间闭锁。
肛瘘需要手术治疗。术后通过伤口换药，局部中药熏洗治疗和红外线理疗等，一般一个月左右就能够痊愈。