感染汉坦病毒是有潜伏期的。
人感染汉坦病毒后潜伏期通常为7-14天，也偶见短至4天或长至2个月者，在潜伏期过后临床表现有三大主征发热、出血和肾损害。
患者起病急，早期会有发冷，随之体温升高的症状，全身酸痛、乏力呈衰竭状；也可有头痛、眼眶痛、腰痛或者面、颈、上胸部充血潮红、呈酒醉貌；这个时候可能会出现眼睑浮肿、结膜充血、水肿、有点状或片状出血的情况出现。
病程经过有发热期、低血压休克期、少尿期、多尿期和恢复期五期。