病毒的类型有很多，不同的病毒感染有着不同的潜伏期。
如果是呼吸系统病毒感染，潜伏期可在数日至3周左右，大多患者7天内可出现相关症状。而肠道病毒的潜伏期要短一些，短则数小时，长则数日，大部分在1~2日内发病。此外，还有EB病毒感染，潜伏期多为4~7周。而艾滋病病毒的潜伏期，从感染到出现症状的时间一般为2~3周。这时可能会出现身体乏力、打喷嚏、头痛、低热等急性期症状，在此之后可进入无症状期。
除此之外还有乙型脑炎病毒，可有2周左右的潜伏期。因此病毒不同，潜伏期也有一定差异。