喉咙部位有水疱，考虑主要是因为病毒感染所造成的疱疹性咽峡炎的疾病，所引发的症状。
当柯萨奇病毒或者肠道病毒等进入到咽喉部位时，就会导致咽喉黏膜或者其他皮肤黏膜出现疱疹性的反应。此类疾病具有明显的自限性，通常临床症状并不严重的情况下，不建议特殊使用抗病毒药物治疗。
但如果除了喉咙有水疱以外，还伴随身体的发热、精神萎靡以及无法正常进食等异常，可以通过服用抗病毒药物缓解临床症状，促进正常生活的恢复。