肛门出现水疱，想要判断是怎么回事，需要依据自身的实际情况和实验室检查结果进行。
如果肛门周围出现的水疱，伴随着明显的疼痛，出现一段时间之后会自己消失，后期容易反复发作，考虑有可能是生殖器疱疹。建议到当地医院抽血化验单纯疱疹二型病毒抗体，如果抗体阳性，就可以确诊。
如果肛门周围出现的水疱不疼不痒，除了在肛门部位出现水疱之外，在腋下等皮肤较为柔软的部位，也会出现类似水疱，并且容易出现破裂。做病理学检测，能够看到明显的表皮水疱，考虑有可能是慢性良性家族性天疱疮，这种情况属于一种基因遗传性疾病。