卵泡囊肿通常不会引起月经不调。这是因为卵泡囊肿不会影响女性的正常排卵，也不会影响卵巢分泌雌、孕激素，所以卵泡囊肿在发生以后，一般不会影响女性的月经，既不会影响月经周期，也不会影响女性的月经量。
只是有些卵泡囊肿在比较大的时候，可能会出现囊肿的扭转或者破裂，而引起急性的下腹部疼痛表现。
但对于月经失调的女性，一般都不考虑是由于卵泡囊肿引起，绝大多数都是卵巢内分泌功能失调导致，但也有可能是子宫上长的包块引起，比如有子宫肌瘤的女性就可能导致月经失调。