先天性高肩胛症的危害有：
1.先天性高肩胛症会导致双侧肌肉不平衡，若受到外伤，可引起固定关节的韧带松弛，从而导致肩关节移位。
2.导致肩关节外展上举功能明显受限，患肢肩胛带肌肉不发达，肩胸活动受到障碍，肩外旋活动受限等功能障碍。
3.年龄稍大的患者可合并肩胛骨与脊柱有骨桥相连，以及其它的胸颈椎及肋骨畸形。
4.还可并发肌性斜颈，使头部向患侧倾斜，颜面转向对侧。
5.由于一侧肌肉长期处于紧张状态，进一步加重颈椎侧弯，导致颈肩部的疼痛进一步加重，甚至形成骨刺。