直肠炎如果不进行正规科学的治疗，而导致长期不好转，有可能转变为慢性的直肠炎，导致治疗困难或者反复发作。
根据发病原因的不同，直肠炎可以分为很多种类型，其中感染性直肠炎和过敏性的直肠炎，治疗起来较为简单，病情也很快便可好转。
炎性的直肠炎，例如溃疡性直肠炎，由于病因比较复杂，治疗起来比较困难，治疗周期也较长，但只要经过规范科学的治疗，配合生活及饮食的干预，多数患者症状可明显好转或者痊愈。如果不经过及时规范的治疗，会导致病情迁延不愈或者症状反复发作。