大脚趾指甲变黑最常见的是甲真菌病，会有指甲变黄或者变黑，有些是明显增厚、混浊，需要到正规医院皮肤科做真菌镜检，明确诊断后，给予抗真菌药物进行治疗，可以外用盐酸阿莫罗芬茶剂等。如果肝肾功能正常者还可以配合口服抗真菌药物进行治疗，可以选择伊曲康唑分散片，或者盐酸特比萘芬片等治疗。
还有一种情况，大脚趾甲变黑是由于外伤所导致指甲瘀斑，又叫甲下瘀斑，表现为指甲变黑，这种情况通常会逐渐自然消退。还有一种情况考虑是甲母痣，这种就要及时到医院去进行治疗。