慢性结肠炎的治疗需要根据患者个体的情况来具体分析。
慢性结肠炎在临床上主要指克罗恩病和溃疡性结肠炎这两种疾病。它们主要是由于自身免疫紊乱引起的，这种疾病没有说能够彻底地根治，只能说是缓解症状。每次发作的时候，患者的症状可轻可重，轻的可以每天腹泻一到两次，重的可以一天腹泻十几次。
比较轻的患者在服用药物治疗以后，病情在很短的时间就能够稳定；但是如果症状比较重，甚至是并发了一些出血、穿孔症状的患者，有的就需要进行手术治疗，这样的患者恢复起来就比较慢，可能需要两年、三年甚至更长的时间。