化脓性指头炎可以吃青霉素类、头孢类的抗生素。因为化脓性指头炎多是由革兰氏阳性菌，包括表皮葡萄球菌以及金黄色葡萄球菌感染所致的。而青霉素类的药物和头孢一代的头孢唑林等对革兰氏阳性细菌有非常好的杀菌效果，所以可以选择青霉素和头孢唑林作为口服消炎药。
但是如果化脓性指头炎所感染的细菌出现变异，对青霉素或者头孢类抗生素产生耐药性就不能选择口服药物，需要使用对耐药细菌敏感的万古霉素进行抗感染治疗。万古霉素是一类国家管控非常严格的药物，需要临床医生以及感染科会诊之后才可以使用。
此外患者化脓性指头炎形成脓肿还需要手术治疗，进行切开引流。