妊娠合并急性肾盂肾炎主要是使用药物治疗。可以先给予抗生素，经验性的使用抗生素，等到尿液或者是血培养以及药敏实验结果出来以后，再进行抗生素的调整。常用的是头孢菌素类的抗生素，需要持续用药10~14天。
其它方面的治疗，孕妇要卧床休息，并多采取左侧卧位，可以减少子宫对于输尿管的压迫，使尿液引流通畅。持续高热的患者要积极采取降温措施，以避免并发症的发生。
鼓励孕妇多饮水可以稀释尿液。每天保持尿量达两升以上。定期监测生命体征，包括血压、脉搏、呼吸、尿量等，监测胎儿胎心以及B超生物物理评分等。