肛周脓肿二次复发还是需要行手术治疗的。复发的原因可能是由于炎症治疗不彻底，造成脓肿的再次发作，这时候需要手术切开脓肿，使脓液得到充分的引流，然后给予抗感染治疗，促进脓肿的愈合。
还有可能是脓肿已经发展到肛瘘的程度，形成了瘘管，从而造成脓肿反复的出现。这时候只能进行手术治疗，对其内口进行处理，切除瘘管，然后促进创面的愈合，这样才能彻底的给予治疗。
治疗的同时要注意清淡饮食，不要吃辛辣刺激性的食物，不要抽烟和饮酒。