肠胃炎急性发作期不能打新冠疫苗，病情缓解期可以打。
在肠胃炎急性发作期，通常是体内的细菌或病毒非常活跃的时候，而且肠道也处于易激惹的状态。由于新冠疫苗的原理是将新冠病毒进行人工减毒、灭活之后接种到人体内，使人体通过主动免疫和被动免疫的方式产生抗体。因此，在身体正处于抵抗细菌、病毒等外来物质时，进行新冠疫苗的注射，有可能会导致出现更明显的胃肠道反应或者接种失败。
但是，有些人长期患有慢性肠胃炎，这种病情控制比较平稳时，通常不发作，称为病情的缓解期。这个时期可以进行新冠疫苗的注射，只需要在注射时与接种医生充分沟通。