患细菌性阴道炎时，治疗原则是抗厌氧菌药物治疗。 ①全身用药。首选甲硝唑400mg，口服，每日2次，共7天；其次为替硝唑2g，口服，每日1次，连服3天；或者替硝唑1g，口服，每日1次，连服5天；或者克林霉素300mg，口服，每日2次，连服7天。不推荐甲硝唑2g顿服。 
②局部用药。甲硝唑阴道栓或片200mg，每日1次，阴道上药，共5-7天；或2%克林霉素膏2g，阴道上药，每晚1次，共7天。替换方案：2%克林霉素软膏阴道涂抹，每次5g，每晚1次，连用7天。
③可选用恢复阴道正常菌群的制剂。妊娠期：妊娠期细菌性阴道病甲硝唑治疗需执行知情选择原则。 ①首选方案：甲硝唑400mg，口服，每日2次，共7天。 ②替换方案：克林霉素300mg，口服，每日2次，共7天。 哺乳期：选择局部用药，尽量避免全身用药。