对于尿道与阴茎结核属于泌尿生殖系统结核的一部分，一般有三方面原因所致：
一、是由于本身肾结核顺着泌尿系统下行感染到尿道。
二、是由于生殖系统本身有结核分支杆菌的感染，如附睾结核、前列腺结核，从而引起尿道结核的产生。
三、是由于血行播散引起，如患者存在肺结核或者腰椎结核，从而通过血行播散感染阴茎海绵体，导致阴茎结核的产生。
对于此类患者需要同阴茎恶性肿瘤相鉴别，因为阴茎恶性肿瘤和阴茎结核都会导致阴茎出现溃疡、皮肤溃烂，那么可以进行活组织检查，送到病理科进行化验，如果镜下明确有恶性肿瘤细胞。阴茎恶性肿瘤一旦确诊，必须及时进行手术治疗，而对于尿道与阴茎结核，需要去泌尿外科或者感染科进行就诊，使用一线抗结核药异烟肼、利福平、吡嗪酰胺和乙胺丁醇进行联合足量足疗程的正规治疗。