肠道内发生内瘘的原因，主要是由于肠壁浆膜层的损伤或自发破口，导致损伤部位与其他肠管炎症渗出粘连，其粘连部位由于肠道内消化液的作用下腐蚀另一段肠管壁，最终导致两段肠管腔相通。
如果内瘘口粘连致密，一般不会影响消化、吸收功能，也不会出现临床症状。但如果肠道内瘘口发生破溃，则会跟外瘘一样，引起营养丢失和感染，因此需要按肠道外漏处理。由于肠管发生了粘连，有可能因此导致内疝的发生。
一旦出现内瘘，如果出现症状，需要给予放置引流管保守治疗或者手术治疗。