想要根治慢性扁桃体炎，需要结合患者扁桃体的肥大程度以及患者的临床症状来判断。
慢性扁桃体炎发作次数并不频繁，且临床症状比较轻微的患者，可以在疾病发作后，通过服用青霉素等抗感染药物或者氯雷他定等抗过敏药物来进行治疗。
扁桃体肿痛严重的患者，还可以通过雾化吸入的方式来缓解。
但对于每年慢性扁桃体炎的发作次数大于三次，且扁桃体的部位有明显的肿大改变，甚至影响了患者正常的呼吸和睡眠的情况，则应当进行扁桃体的切除手术来实现疾病的根治。