当真菌感染了泌尿系统，就会引起真菌性尿路感染。这时病人可能会表现尿频、尿急、尿痛，有时候会有发热、尿液浑浊等现象。往往真菌性尿路感染是逆行感染引起的，真菌可以通过尿道外口逆行感染到泌尿系统，而引起真菌性尿路感染。
这种情况往往是病人抵抗力比较差，而且有些基础疾病比如糖尿病，以及病人可能有长期服用抗生素的习惯，或者尿道口插有导尿管或者行膀胱造瘘，这些原因很有可能会导致真菌性尿路感染的发生。也有可能会通过血液传播给泌尿系统，而出现真菌性尿路感染，比如肺部有真菌感染，当感染没有得到及时有效的控制，真菌可以通过血液系统传播给泌尿系统，而出现真菌性尿路感染。