鼠疫患者的隔离方式叫做严密隔离，指的是患者住单间病室，同类的患者可以住同一病室。关闭房门，禁止陪护和探视患者。
进入病室的医务人员要戴帽子、戴口罩、穿隔离衣、换鞋，要注意手卫生与消毒、要戴手套。对于患者的分泌物、排泄物、污染物品、敷料等要严格地消毒。
室内应采用单向正压通气，室内的空气及地面定期喷洒消毒液或者是紫外线照射。腺鼠疫的患者隔离至淋巴结肿大完全消散后，再观察7天。肺鼠疫的患者，要隔离至痰培养6次阴性才能解除隔离。患者死亡后，尸体应用尸袋严密包扎后焚化。