绝大多数的肠胃炎患者不需要进行肠镜检查。一般患有肠胃炎的患者，多需要进行检查大便常规、粪便培养等，根据检测结果明确是否有细菌和病毒感染，针对病原体进行相应的治疗。
但是，有些胃肠炎患者会出现反复发作情况，而且病程比较长，需要做肠镜检查。在进行肠镜检查时，可以观察肠道黏膜内情况及是否有占位性病变存在，还可以取组织进行活检。
患有肠胃炎症的程度、时间长短不一样，治疗方法也存在差异性，但是不及时治疗有可能会形成慢性炎症。