鳃裂瘘管是有可能会引发咽部不适的情况出现的。
一方面，鳃裂瘘管通常会造成患者的颈部出现明显的包块或者是分泌物，此时颈部就会有明显的疼痛感等症状出现。当颈部的疼痛感向咽喉部位蔓延时，就会引发咽部不适的现象出现。
另外一方面，鳃裂瘘管还有可能引发耳部，或者是口腔等其他部位的化脓性炎症感染疾病出现。此类疾病一旦发病，有可能会对咽部黏膜造成刺激，从而引发急性咽喉炎等并发症出现。而急性咽喉炎一旦发病，也会造成咽部不适表现。