儿童肌酐偏低的原因多数是由生理性因素所造成，极少数是病理因素造成的。
病理因素方面是指儿童由于久病、重病造成的形体消瘦，肌肉量减少或者是进食蛋白质类食物明显减少所造成的。
生理因素方面是因为儿童的骨骼肌含量较成年人明显少，而肌酐是由肌肉产生的代谢废物。所以儿童的肌酐含量较成人明显减低，且儿童正常的食量也较成年人为少。所以摄入的蛋白质含量偏低，这些因素均可以造成血肌酐偏低。