打完流感疫苗后发烧，可以是流感疫苗的不良反应，也可以是合并其他感染性，或非感染性疾病导致发烧。
注射流感疫苗后，在短期之内可能出现疫苗的不良反应。注射1~3天内出现发热，但多以低热为主，一般不伴有咳嗽、咳痰、腹痛、腹泻等器官感染的症状。发热多为低热，2天左右可以自行缓解，可以给予患者物理降温治疗。
如果注射流感疫苗后出现发热，伴有明显的感染性症状。如剧烈的咳嗽、咳黄痰、腹泻、腹痛、尿频、尿急、尿痛，或既往有风湿或肿瘤性疾病，出现再次高热，要去医院进一步检查。