左侧卵巢囊肿的原因，大多是和先天因素有关。这个并不是因为患者的生活行为或者是其他系统的疾病问题，或者是应用药物等而影响。
也有的只是女性短暂的内分泌失衡而导致的生理性的卵巢囊肿出现，常常会在之后做复查就可以自动地消失。有很多的卵巢囊肿并不能找到明确的原因，但是有的卵巢囊肿必须接受尽早的手术治疗才可以。
比如体积比较大的畸胎瘤，或者是巧克力囊肿，或者浆液性囊肿等，或者是生长速度比较快的囊肿，或者是肿瘤标志物检查明显异常，考虑有恶性的可能。