尿路结石形成的原因有很多，如尿液成分的改变、尿液酸碱度的改变、尿路生理结构的改变及尿路炎症等。
如每日摄入的水量较少，或大量出汗、急慢性腹泻、呕吐等导致人体水分丢失而未得到充分补充时，此时为了保证足够的有效血容量，则会出现尿液浓缩，是尿路结石形成的原因之一。
尿路炎症时患者尿液中可有炎性分泌物、絮状物增加，这种情况下也容易形成尿路结石。
如患者有高尿酸血症，或口服噻嗪类利尿剂、苯溴马隆等可增加尿酸排泄的药物时，尿液中就很容易形成尿酸盐结晶，从而容易形成尿路结石。
当患者有前列腺增生引起尿路梗阻，或其他疾病导致的尿潴留时，或者是有憋尿习惯，尿液在膀胱内储存的时间较长，也是尿路结石形成的原因之一。
长期大量进食富含钙盐或草酸盐的食物，特别是将两种食物一起烹饪食用，就容易形成难溶于水的草酸盐，导致尿液中草酸钙结晶增多，逐渐形成结石。