新冠病毒变异会导致新冠病毒生理、病理特性改变，从而对新冠病毒的繁衍能力、侵袭能力、致病性产生一些差别。对于人类社会的影响，会随变异特性的不同而存在一定差异。
如果新冠病毒变异后，其免疫抗原特性变异较大，则可以导致已经存在的免疫相关性抗体失效，从而导致原有的新冠疫苗效果减弱。
如果新冠病毒变异后传染性增强、病毒毒性增强，则可以导致感染人群增加，重症感染人群增加，对人类社会危害性增加。如果新冠病毒变异后，其传染性以及致病性下降，则对于人类社会危害性减低。