根管治疗后咬合痛不正常，可能是发生了以下几种情况：
1.牙冠部的充填物存在咬合高点，与对颌牙齿形成咬合创伤，造成牙齿咬合疼痛。
2.采用过氧化氢溶液或次氯酸钠溶液冲洗根管时，部分药液超出根尖孔，导致牙根肿痛。
3.牙胶尖或根充糊剂等，如果超出根尖孔2mm以上，也会引起应激性反应。
4.根管预备器械，如扩大针等，将坏死组织推出根尖孔外，可引起细菌感染，造成咬合疼痛。
5.根管侧壁发生穿孔或折裂时，牙槽窝内产生大量炎性物质，使牙齿不敢咬合。