发烧、后脑勺疼的原因可能是颅高压、炎症反应、病毒血症。
导致发烧的最常见的原因就是病毒或者细菌的感染，感染之后引起全身性的炎症反应。这种发烧和炎症反应有可能会导致脑血管的扩张，引起脑血流量增加，最终会出现颅内压升高。颅高压引起头疼，还会导致恶心、呕吐、脖子僵硬的表现。另外，导致感染、发烧的病毒和细菌，会在体内释放出一些毒性的物质和很多的炎性物质，这些物质流到了脑血管和脑部的组织，会刺激大脑产生疼痛的感觉。
治疗的关键还是尽快控制感染、控制发烧，这样后脑勺疼的情况也会逐渐缓解。