单纯性肛瘘的就诊科室最准确的就是肛肠外科，但事实上很多的医院里面并没有独立的肛肠外科，其肛肠外科医生有可能归属于普通外科。在很多西医综合性医院里面有可能为结直肠肛门病科或者就是普外科。
而中医综合性医院或者中西医结合医院里，大多都会有独立的肛肠科。所以患者如果得了肛瘘，具体的就诊科室还是应该先找肛肠外科；
如果该医院没有肛肠外科，可以去普外科或者结直肠肛门外科就诊。具体还是应该咨询就诊医院，可以在门诊挂号处的分诊台咨询。