新冠病毒的核酸检测均需要在PCR实验室进行，一般大型三甲医院的检验科均配备有PCR实验室，所以核酸检测均由医院的检验科负责。
但同时，某些第三方检测机构也配备有PCR 实验室，也可以进行新冠病毒的核酸检测。
一般在标本的检测过程中，样本的打开、振荡、离心等均可能会产生气溶胶，有感染的风险。因而各PCR实验时均会设有缓冲区，在各个缓冲区之间，会通过气压的调节，使整个检测过程中试剂和标本免受气溶胶的污染。