桥本甲状腺炎的治疗方法，主要取决于桥本甲状腺炎对于功能的影响。
如果桥本甲状腺炎没有影响到功能，TPO抗体是高滴度或者低滴度都无需特别治疗，只需要定期随访甲功即可。如果影响到了功能，出现了甲亢，则需要给予抗甲状腺药物治疗。需要注意的就是，一般抗甲状腺药物的剂量要偏小一些，而且复查甲功要偏勤一些。
如果影响到功能出现了甲减，则需要给予补充甲状腺激素的药物治疗。可以选择LT3或者LT4，一般会优先选择LT4的替代治疗。