窝沟容易积聚食物残渣和细菌，而且通过刷牙是很难清除干净的，容易引发牙齿发生龋坏。龋齿是临床上比较常见的疾病，多数牙齿龋坏发生在窝沟部位。
因此为了预防龋齿的发生，对于窝沟比较深的人，最好及早进行窝沟封闭治疗。窝沟封闭是在窝沟处涂抹一层封闭剂，这种封闭剂不仅可以充填窝沟，而且其表面也比较光滑，不易于食物残渣以及细菌的积聚，也可以有效的预防龋齿的发生。
进行窝沟封闭的牙齿多数为六龄齿，因为六龄齿萌出时间比较早，一旦窝沟过深，很容易引发龋病。