耳朵的真菌感染，可以通过耳部灌洗、局部用药以及全身用药等方式来进行治疗。
在真菌感染并不严重，且耳道内没有形成不良的液体或者是真菌团块等物质时。可以直接通过在出现真菌感染的皮肤黏膜部位，涂抹达克宁、派瑞松或皮炎平等抗真菌类型的软膏，通常就可以有效地起到去除真菌的功效。
但是对于耳道内已经出现了明显的流脓、发痒以及结痂等情况，甚至是引发了耳道堵塞、闷胀及听力下降等表现。则需要使用双氧水或生理盐水对耳道进行灌洗，保持耳道内的干净及通畅，之后再使用抗真菌类型的药物进行治疗。