急性单纯性咽炎在患病后，服用的药物种类需要根据咽喉部位存在的致病菌种类来判断。
如果是腺病毒等病毒感染引发，则可以选用阿昔洛韦、抗病毒合剂等抗病毒药物来治疗。如果是由于溶血性链球菌等细菌感染引发，则可以选用青霉素或头孢等抗生素类药物来治疗。对于患者咽喉部位有较为严重的充血、水肿或者是痰液分泌等症状时，可以考虑配合服用强的松等糖皮质激素类的药物来进行抗炎、消水肿的治疗。
此外，患者还可以遵医嘱服用咽炎片等中成药物来治疗。