囊肿有可能会引起肿瘤标志物偏高。
但是囊肿作为一种良性病变，引起肿瘤标志物偏高的数值升高幅度一般不大。并且这种肿瘤标志物偏高的数值，大多不会出现较大的波动，并且多数偏高的数值不会出现持续性增高的趋势。
对于囊肿引起的肿瘤标志物偏高，可以通过囊肿完全手术切除，从而使指标恢复正常水平。例如卵巢囊肿的患者常会出现CA125或者CA199等肿瘤标志物高于正常水平，囊肿手术治疗后这两项指标大多可以恢复正常水平。