睡中午觉后头痛可能与睡眠时间过久有关。当睡眠时间过久后，可能会导致大脑缺氧或者是缺血，醒后就会出现头痛，应当控制睡觉的时间，午睡的时间尽量不要超过30分钟。
如果在中午趴着睡觉，并且本身存在颈椎病，有可能会导致颈椎病加重，也会引起明显头痛，主要为颈性头痛，应当避免趴着睡觉，并且在工作当中也要保持合理的坐姿，防止颈椎病持续加重。
如果午睡时身体着凉引起感冒，也会导致睡醒后头痛，可能还伴有咽喉疼痛、鼻塞、流鼻涕等症状。