环咽肌失弛缓症的确诊，需要依据患者的临床症状及检查结果来判断。患上环咽肌失弛缓症的患者，往往临床症状还是比较典型的。
患者会出现明显的液体或固体性食物难以下咽，下咽后反流、咳呛，食物停留在咽部，身体消瘦等表现。同时，此类患者在进行食管造影检查时，往往可以明显地观察到咽部肌肉收缩及协调能力有异常，存在运动性的功能障碍的情况。
医生会对患者可能存在的咽喉炎症性疾病、咽喉憩室，或是咽喉囊肿等疾病进行排除。此时，就可以确诊环咽肌失弛缓症的疾病。