卵巢囊肿做手术是否影响生育，与手术的方式有关系，不同的手术方式影响程度是不同的。
卵巢囊肿直径比较大、恶性程度比较高的患者，在治疗上是以手术治疗为主。手术治疗主要是以囊肿切除、卵巢输卵管切除为主，不同的手术方式对生育的影响是不同的。
如果患者采用的是卵巢囊肿切除术，能够保留正常的卵巢组织，因此对生育不会造成影响；但是如果采用的是卵巢输卵管切除，尤其是双侧卵巢切除，由于没有了卵巢，因此女性不会存在有排卵功能，这种手术方法就会直接对生育造成影响。