粒性白细胞缺乏性咽峡炎的病情发展较快，容易出现脓毒血症以及肺炎等并发症。治疗主要在全身治疗，同时要去除致病因素，以促进粒细胞生长，治疗的同时要重视控制感染，并合理采用支持疗法，对咽部和口腔部位可用1%的双氧水或者是复方硼酸液漱口。
在治疗同时还要注重日常护理，要有一个良好的休息和养病环境，并要做好心理疏导，缓解患者的负面情绪，帮助建立康复信心。
日常要合理进行体育锻炼，提高身体免疫功能，还需注意保暖，预防感冒，不要吃辛辣刺激性的食物，用盐水漱口，保持口腔清洁。