肾结石一般不会影响精子成活率。
肾结石是泌尿系统疾病的的范畴，很少会影响生殖系统，但如果肾结石患者同时合并严重细菌感染时，致病菌可进入生殖系统，很有可能会导致精子成活率不高。所以如果肾结石合并感染期间，建议不要同房，避免精液中出现脓液，可导致精液感染、精子畸形以及活力下降等情况。
如果精子活力低或者成活率不高，可能和精索静脉曲张、生殖系感染以及使用抗代谢药物等有一定的关系，建议进一步查找病因再进行治疗，才能获得满意效果。