肾结石一般不会对精子产生影响。但如果肾结石导致严重的肾积水，影响了肾脏功能或者出现肾脏积脓的情况下，有可能会引起生殖系统感染，比如睾丸炎、附睾炎、精囊炎，这时候就会影响精子，导致精子的数量减少，精子活动率降低，精子液化的时间延长，甚至不液化。
如果肾结石合并感染，有积脓的情况下，不建议同房，有可能会导致精液感染。有肾结石，但是没有合并肾积水、积脓、感染，通常不会影响精子。
有不少患者肾结石比较小，也没有临床症状，没有出现梗阻，结石可以长期存在，不会对人体造成很大的影响，也不会对精液造成任何影响，只需要定期复查观察就可以。