阿米巴痢疾主要是对患者的粪便进行处理，对于患有阿米巴痢疾的患者，粪便需要进行妥善处理，避免传染给其他人。
一般在进行消毒处理的时候，会有专门统一的人员进行，主要是彻底杀灭粪便当中的寄生虫和虫卵，而且还需要对粪便进行集中掩埋，避免具有携带阿米巴虫卵的大便污染食物和水源。
另外，在日常生活当中还需要多注意，使用温水清洗肛门及周围的皮肤，还需要对患者的餐具、便器单独使用消毒。在进行粪便培养时，连续三次出现阴性情况才可以解除隔离。