婴儿口腔上腭疼痛一般是因为口腔溃疡。如果是常见的外伤性口腔溃疡，则可以在患处涂抹消炎药或者是喷雾，或者是重组纤维细胞生长因子凝胶，缓解疼痛。这些药物见效较快，不会作用于全身，不会对婴儿造成过强的不良反应，并且可以促进局部溃疡的愈合。
如果是其他疾病导致的婴儿口腔溃疡，常见疾病有疱疹、鹅口疮等，需要去医院求助医生进行治疗。婴儿口腔上腭疼痛时，不能吃辛辣刺激的食物，避免刺激患处加重病情。
病毒感染引起的口腔溃疡，要注意婴儿卫生。定时消毒婴儿的奶瓶、衣物、玩具等。母乳喂养的婴儿，母亲要保持乳头清洁。