对于婴儿便秘的治疗，可以选择药物治疗方法、物理治疗方法以及食疗的方法。
药物治疗方法可以选择润肠通便的中成药，配合益生菌进行治疗，比如可以使用小儿七星茶配合双歧杆菌等益生菌类药物进行治疗。物理治疗方法可以在宝宝的肚脐周围呈顺时针方向轻轻按摩，促进肠道蠕动，促进排便。必要时可以在宝宝的肛门部位用温热的肥皂水进行清洗，可以刺激肛门达到通便的作用。
饮食方面要注意给宝宝多喝水，可以适当的多吃水果和粗纤维的蔬菜，有助于通便。