新生儿胃穿孔手术后除了注意要胃管是否通畅、出入量、体温变化、有无腹胀，还要注意患儿的精神状态，尽量不要大声哭闹，勤翻身，避免局部长时间受压，影响局部血液循环引起硬种。
保持室内空气的湿度适宜，避免空气干燥引起咳嗽。新生儿胃穿孔的远期并发症有生长发育迟缓、缺铁性贫血、脂肪泻等。所以在后期如果患儿可以进食的时候要注意护理，进奶水尽量做到循序渐进，注意监测体重的增长变化。
因为婴幼儿期生长发育快，注意复查血红蛋白和大便常规。如果有缺铁性贫血或者脂肪泻的情况，及时的用药治疗，避免影响患儿生长发育。