消化不良伴有腹胀、口臭，可以通过生活饮食习惯调整，也可以通过药物进行治疗。如果消化不良症状不重，可以先调整饮食，以清淡易消化食物为主，避免高脂肪、高蛋白饮食。根据个人身体条件适当增加运动促进胃肠动力，以及减轻压力、改善睡眠、调节情绪。
如果经上述生活饮食调整后症状仍缓解不理想，也可以应用胃肠动力药物如莫沙必利、伊托必利等。老年人也可以应用消化酶、益生菌粉，如双歧三联活菌胶囊、复方嗜酸乳杆菌片等。
口臭明显的病人，建议做呼气试验除外幽门螺杆菌感染。如结果为阳性，还需要根据当地耐药情况和病人基础用药情况，选择含有铋剂的四联疗法进行根除治疗。