目前新型布尼亚病毒是没有疫苗的。因此高危人群是无法通过注射疫苗产生有效抗体来进行预防。
所以在户外作业或户外活动的人群，尤其需要在山地、丘陵地区经常会遇到蜱虫的地方，要注意穿高筒靴，勒紧裤腿，以防止蜱虫的叮咬，通过加强个人防护的方式来预防新型布尼亚病毒的感染。
由于患者的血液、血性分泌物、排泄物也同样具有传染性，因此医护人员和陪护的人员需要接触患者的血液、分泌物、排泄物、体液的时候也需要带乳胶手套。当从事气管插管等可能接触到患者血液分泌物操作时，应穿隔离衣、戴护目镜进行预防。